真核生物のゲノムは、遺伝子配列や機能性RNA配列（rRNA、tRNAなど）をコードしない非コード配列を含んでいる。このような領域のほとんどは機能を持たず、中立に進化しているため変異が蓄積し、種間でゲノムを比較した時、その保存性は観察されない。しかし、脊椎動物のゲノム内には中立進化では説明できない進化的に保存された非コード領域が存在し、CNS （conserved non–coding sequence）やCNE （conserved no……
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